{"id":31,"date":"2021-04-12T15:58:59","date_gmt":"2021-04-12T13:58:59","guid":{"rendered":"https:\/\/acepartnerz.kinsta.cloud\/dstn\/?post_type=projet&p=31"},"modified":"2021-09-30T16:33:59","modified_gmt":"2021-09-30T14:33:59","slug":"sec-fedgen","status":"publish","type":"projet","link":"https:\/\/ace-partner.org\/dstn\/projet\/sec-fedgen\/","title":{"rendered":"SEC FEDGEN"},"content":{"rendered":"\n

Titre : <\/strong>D\u00e9veloppement d’une architecture cloud g\u00e9nomique f\u00e9d\u00e9r\u00e9e et s\u00e9curis\u00e9e pour la m\u00e9decine de pr\u00e9cision en Afrique<\/p>\n\n\n\n

Type de projet : <\/strong>Projet de recherche (4 ans)<\/p>\n\n\n\n

R\u00e9sum\u00e9 : <\/strong>
Le s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration et d’autres technologies \u00e0 haut d\u00e9bit transforment actuellement la recherche en sciences de la vie et en soins de sant\u00e9 dans le monde entier. L’informatique en nuage a donc \u00e9t\u00e9 adopt\u00e9e pour r\u00e9pondre aux besoins de stockage et de calcul de haut niveau des chercheurs. Parall\u00e8lement, le d\u00e9ploiement de l’architecture en nuage autonome traditionnelle se heurte \u00e0 la limitation des ressources de calcul et de stockage en p\u00e9riode de pointe. Pour y rem\u00e9dier, l’id\u00e9e d’une interconnexion de plusieurs nuages, connue sous le nom de nuage f\u00e9d\u00e9r\u00e9, a \u00e9t\u00e9 d\u00e9velopp\u00e9e afin de r\u00e9aliser des collaborations interinstitutionnelles en mati\u00e8re de stockage et de puissance de calcul. Les architectures de nuages f\u00e9d\u00e9r\u00e9s existantes publi\u00e9es pour des communaut\u00e9s de recherche g\u00e9n\u00e9riques, telles que le nuage f\u00e9d\u00e9r\u00e9 du GARR, le nuage f\u00e9d\u00e9r\u00e9 europ\u00e9en et le nuage ouvert du Massachusetts, sont strictement accessibles aux chercheurs dans leurs domaines g\u00e9ographiques respectifs. Le nuage g\u00e9nomique du Canada se concentre aussi sp\u00e9cifiquement sur les activit\u00e9s de recherche g\u00e9nomique en vue d’une m\u00e9decine de pr\u00e9cision au Canada. Contrairement \u00e0 leurs homologues des r\u00e9gions d\u00e9velopp\u00e9es, la raret\u00e9 des infrastructures de stockage, de traitement et d’interpr\u00e9tation des donn\u00e9es est un facteur limitant majeur pour la d\u00e9couverte, l’innovation et la m\u00e9decine de pr\u00e9cision en Afrique.  Il existe sur le continent quelques institutions et consortiums disposant de ressources informatiques performantes. Il s’agit notamment du consortium H3Africa\/H3Abionet (h3africa.org et h3abionet.org) et de WACREN, mais pour l’instant, la plupart de ces ressources fonctionnent plut\u00f4t en silos. Par cons\u00e9quent, l’objectif de ce projet de recherche est de d\u00e9velopper une architecture f\u00e9d\u00e9r\u00e9e s\u00e9curis\u00e9e de nuage g\u00e9nomique pour la recherche collaborative, vers une m\u00e9decine de pr\u00e9cision en Afrique. L’architecture de f\u00e9d\u00e9ration en nuage comprendra une infrastructure mat\u00e9rielle, des logiciels libres, un mod\u00e8le de s\u00e9curit\u00e9 et de confidentialit\u00e9 des donn\u00e9es, des interfaces et des protocoles de f\u00e9d\u00e9ration. Pour atteindre cet objectif, deux \u00e9tudiants en doctorat seront recrut\u00e9s pour travailler respectivement sur i) l’\u00e9volution d’une architecture de nuage g\u00e9nomique f\u00e9d\u00e9r\u00e9e s\u00e9curis\u00e9e (SEC-FEDGEN) et ii) le d\u00e9veloppement d’un mod\u00e8le de s\u00e9curit\u00e9 et de confidentialit\u00e9 des donn\u00e9es dans un nuage f\u00e9d\u00e9r\u00e9. Des bancs d’essai de d\u00e9monstration de concept (PoC) seront d\u00e9velopp\u00e9s pour \u00e9valuer et valider les composants de l’architecture SEC-FEDGEN. Plus pr\u00e9cis\u00e9ment, sur la base de l’architecture \u00e9volu\u00e9e, des bancs d’essai en nuage g\u00e9nomique seront mis en place sur quatre sites diff\u00e9rents de partenaires CApIC-ACE au Nigeria et en R\u00e9publique d\u00e9mocratique du Congo (RDC) gr\u00e2ce au financement d\u00e9j\u00e0 obtenu dans le cadre du projet ACE Impact de la Banque mondiale. Ces bancs d’essai de nuage g\u00e9nomique seront f\u00e9d\u00e9r\u00e9s pour r\u00e9aliser un prototype d’infrastructure de nuage g\u00e9nomique f\u00e9d\u00e9r\u00e9 s\u00e9curis\u00e9 (SEC-FEDGEN) pour le d\u00e9ploiement de la m\u00e9decine de pr\u00e9cision en Afrique. Des API et des services de cloud seront \u00e9galement d\u00e9velopp\u00e9s sur la base du mod\u00e8le de s\u00e9curit\u00e9 et de confidentialit\u00e9 des donn\u00e9es propos\u00e9. Pour les besoins de cette proposition, H3Africa (un consortium panafricain de bioinformatique) s’efforce actuellement d’\u00e9tablir des protocoles pour la m\u00e9decine de pr\u00e9cision en Afrique. En d\u00e9finitive, l’architecture SEC-FEDGEN propos\u00e9e peut servir de mod\u00e8le pour la mise en place de bancs d’essai ou de centres de donn\u00e9es f\u00e9d\u00e9r\u00e9s en nuage pour d’autres domaines de recherche. Le consortium pour cette recherche est compos\u00e9 de CApIC-ACE et CEA-MITIC (avec leurs partenaires industriels et universitaires respectifs). Ce consortium poss\u00e8de des comp\u00e9tences compl\u00e9mentaires en mati\u00e8re de calcul haute performance, d’informatique en nuage, d’intelligence artificielle et de cybers\u00e9curit\u00e9. CApIC-ACE est membre du r\u00e9seau H3Africa\/H3Abionet. Les chercheurs de CApIC-ACE, sous la direction du professeur E. F. Adebiyi, travaillent \u00e0 la g\u00e9n\u00e9ration de donn\u00e9es g\u00e9nomiques (de sujets africains) qui sous-tendent le paludisme, les cancers de la prostate et du sein, avec le financement du projet ACEImpact. L’analyse de ces donn\u00e9es sera pilot\u00e9e sur le banc d’essai SEC-FEDGEN qui sera mis en place.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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