Événements
Atelier de séquençage Wanida
Au 27/04/2024
Dans le cadre du Projet Molecular epidemiology of sars-cov-2 dans les pays d’Afrique de l’Ouest, le réseau WANIDA organise au Centre ouest-africain de biologie cellulaire des agents pathogènes infectieux (WACCBIP) de l’Université du Ghana, qui est le centre de coordination du réseau WANIDA, un atelier de séquençage.
Il aura pour but d’étudier les déterminants génétiques de la virulence et/ou de la pathogénicité du virus chez l’hôte.
Ce workshop verra la participation de tous les membres du réseau WANIDA avec plus de 2 000 échantillons à séquencer.
AGENDA/PROGRAMME
22/04/2024
Informations générales sur la PCR et la préparation des bibliothèques de séquençage
Informations générales sur le séquençage
Étapes d’analyse des données
23/04/2024
Extraction
Linux et les outils de ligne de commande
Contrôle de la qualité des données
24/04/2024
Préparation des Amplicons
Contrôle qualité
Cartographie des Amplicons
Identification des variants
25/04/2024
Préparation des bibliothèques et séquençage (Formation, observation et pratique)
R et R-studio dans l’analyse des données T
Associations univariées des SNP avec les groupes cliniques
Du 26/04/2024 au 27/04/2024
Mise en œuvre du Projet